Postoji nekoliko načina kako da se automobilom dođe do Apatina.
Ukoliko dolazite sa autoputa E-75 iz pravca Beograda, da biste došli u Apatin, sa autoputa ćete se odvojiti kod Vrbasa, a zatim nastaviti preko Crvenke, Kljajićeva i Sombora.
Ukoliko dolazite iz pravca Mađarske, odvojićete se kod Subotice, a onda preko Bajmoka i Sombora dolazite u Apatin.
Iz pravca Novog sada, u Apatin ćete najlakše stići preko Bačkog Petrovca, Odžaka i Bogojeva.
U Apatin se iz Hrvatske najbliže dolazi preko graničnog prelaza Bogojevo, dok su dva alternativna prelaza Bezdan i Bački Breg.